Estuaires : carrefours de migration des poissons migrateurs ! Article 6 : Le flet, poisson sentinelle pour mesurer la santé des estuaires
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Bretagne Grands Migrateurs lance en 2026 une nouvelle chronique "Estuaires : carrefours de migration des poissons migrateurs". Aujourd'hui, le sixième épisode...
Le flet commun (Platichthys flesus), poisson migrateur méconnu de nos cours d’eau, vit la majeure partie de l’année en estuaire. A l’approche de l’été, les flets remontent l’estuaire - plus ou moins en amont selon leur stade de développement - pour se nourrir. A l’approche de l’hiver, les adultes retournent en mer pour se reproduire.
Le flet est considéré en Europe comme une espèce sentinelle d’intérêt majeur pour évaluer la qualité des milieux estuariens (Pichereau et al., 2021) pour plusieurs raisons :
- Son mode de vie benthique : le flet, qui vit au contact des sédiments, est particulièrement exposé aux polluants (métaux lourds, hydrocarbures, contaminants chimiques…) accumulés dans les sédiments de l’estuaire ;
- Sa forte fidélité aux estuaires : l’état de santé des flets, dont les juvéniles et de nombreux adultes fréquentent durablement les estuaires, est fortement relié aux conditions environnementales locales estuariennes ;
- Sa large répartition géographique : le flet est présent dans de nombreux estuaires européens, de la mer Blanche (nord-ouest de la Russie) jusqu’au Maroc, ce qui facilite les comparaisons entre sites et les suivis à long terme ;
- Sa sensibilité aux polluants : Le flet présente des réponses biologiques à la pollution mesurables pour évaluer l’état écologique des milieux (lésions hépatiques, altérations immunitaires, perturbations endocriniennes, dommages à l'ADN…).

Cycle de vie du flet sur les côtes atlantiques françaises (Laroche et al., 2025)
En Bretagne, les projets POPEST 2018-2021 puis ECOEST 2022-2025, portés par le laboratoire LEMAR (Institut Universitaire Européen de la Mer), ont justement développé une approche multidisciplinaire basée sur la géographie des bassins versants, l’hydrobiologie, la chimie des polluants et les réponses biologiques du flet !

Schématisation de l’approche multi-disciplinaire développée dans les projets POPEST et ECOEST (Laroche et al., 2025)
POPEST a dans un premier temps validé le flet comme un très bon enregistreur de la qualité des masses d’eau dans les petits estuaires et a conduit à un premier diagnostic écologique de 5 estuaires bretons. ECOEST a dans un second temps élargi son approche à 11 bassins versants.

Bassins versants étudiés dans le projet ECOEST – les bassins versants de la Penzé, de l’Horn, de l’Aven, du Scorff et du Noyalo étaient déjà dans le projet POPEST (Laroche et al., 2025)
L’analyse de différents tissus du flet – les muscles pour les polluants métalliques et les teneurs lipides, le foie pour les réponses moléculaires et protéomiques et les otolithes pour les métaux, éléments traces et le manganèse, marqueur d’hypoxie – a été croisée à l’approche géographique et l’analyse des polluants dans les sédiments et les eaux. Cette approche s’est révélée d’un intérêt majeur pour approfondir les réponses du poisson au multi-stress en estuaire et identifié les principaux stresseurs interagissant dans les estuaires bretons :

Identification des principaux stresseurs par hydrosystème & principales réponses moléculaires du flet (Laroche et al., 2024)
Réponses du flet aux différentes pressions par bassin versant (Laurent at al., 2024)
bassin pressions réponses du flet GOUESSANT Bassin soumis à une très forte pression agricole et à un élevage intensif Fortes perturbations du cycle de l’urée (++), du métabolisme des lipides (++), du système immunitaire (+++)
Signes d'hypoxie (++)
Stress thermique (++)
Détoxification des polluants (++)
HORN
GUILLEC
FLECHE
Bassin soumis à une très forte pression agricole (pesticides & nitrates)
Fortes perturbations du cycle de l’urée (+++) en particulier sur l'Horn, du système immunitaire (+)
Détoxification des polluants (++)
NOYALO Bassin urbanisé (multi-contamination chimique)
Dysfonctionnement de la station d'épuration
Fortes perturbations du métabolisme des lipides (+), du système immunitaire (++)
Signes d'hypoxie(++)
Détoxification des polluants (++)
ABER WRAC'H
QUILLIMADEC
Bassin soumis à une agricole soutenue Fortes perturbations du métabolisme des lipides (++), du système immunitaire (+)
PENZE Bassin soumis à une agricole soutenue
Amont du bassin versant très préservé
Perturbations du système immunitaire (+)
Signes d'hypoxie (+)
DOUFFINE
SCORFF
Bassin soumis à une agricole soutenue
Amont du bassin versant très préservé
Perturbations du métabolisme des lipides (++) en particulier sur la Douffine
Signes d'hypoxie (++) en particulier sur le Scorff
AVEN Bassin de référence Les gestionnaires des 11 bassins versants étudiés disposent désormais d’un état des lieux (2018-2020) et de « métriques diagnostic » pour suivre l’état de santé de leur fleuve côtier dans le temps, particulièrement en réponse à des opérations de restauration dans les systèmes anthropisés.
Pour en savoir plus, Jean Laroche, chargé de l’étude, interviendra lors de la prochaine journée technique de BGM « Les poissons migrateurs, à l’interface de la mer et la terre » le 13 octobre prochain.
Sources :
- Laroche J., Laurent J., Pichereau V., Le Floch S., Le Berre I., Armengaud J., Waeles M., Devin S., Hiliou J., Baric M., Rivallin A., Le Guern F. (2025). Projet ECOEST : Diagnostic sur l’état écologique des estuaires bretons et production de marqueurs pour la gestion des hydrosystèmes. Rapport de recherche LEMAR-UBO & CEDRE, Agence de l’Eau Loire – Bretagne.
- Laroche J., Laurent J, Pichereau V., Le Berre I., Le Floc’h S. (2024). Diagnostic de l’état de santé des fleuves côtiers bretons, en combinant : Géographie des bassins versants, Chimie des polluants & Réponses du poisson. Colloque Régional « repenser LE LIEN TERRE - MER ». CCI Morlaix, 7 novembre 2024.
- Laurent J., Laroche J., Pichereau V., Le Berre I., Le Floch S. (2024). Projet ECOEST : Diagnostic sur l’état écologique des estuaires bretons & production de marqueurs pour la gestion des hydrosystèmes. LEMAR-UBO & CEDRE. Diaporama.
- Pichereau V., Laurent J., Borcier E., Laroche J. (2021). Projet POPEST : Marqueurs de vulnérabilité de populations de flet identifiés par la protéogénomique : de nouveaux outils pour estimer l’état écologique des systèmes estuariens - Rapport final. LEMAR UMR 6539, UBO, CIEM.
Rendez-vous le mois prochain pour un nouvel épisode !

