Estuaires : carrefours de migration des poissons migrateurs ! Article 4 : Comment se comportent les jeunes salmonidés migrateurs en estuaire ?

Bretagne Grands Migrateurs lance en 2026 une nouvelle chronique "Estuaires : carrefours de migration des poissons migrateurs". Aujourd'hui, le quatrième épisode... 

En estuaire, les jeunes saumons ou les jeunes truites de mer (smolts) lors de leur migration vers la mer, sont confrontés à de multiples défis naturels - prédation, salinité, température… - et anthropiques -pêche, obstacles, aménagements côtiers… Cette phase cruciale pâtit d’un manque de connaissances même s’il est généralement supposé que la mortalité des smolts serait élevée en estuaire en raison de ces nombreuses pressions. 

‍Un suivi acoustique pour étudier le comportement des smolts en estuaire

Le suivi de la migration des jeunes salmonidés a été effectué grâce à l’insertion d’une marque acoustique de petite taille, émettant un bip toutes les 30 secondes, dans la cavité abdominale des individus. Des récepteurs acoustiques installés le long du parcours migratoire des salmonidés ont enregistré la date et l’heure de passage de chaque individu, s’ils sont dans un rayon de 200 m du récepteur lorsque la marque émet.

En 2018 puis 2019, 60 individus de chaque espèce ont été marqués par site (excepté sur le Scorff où seulement des smolts de saumons ont été marqués), soit au total 835 jeunes salmonidés !

En parallèle, des enregistreurs de température, de salinité et d’oxygène dissous ont été déployés en 2019, à l'entrée de chaque estuaire, à environ 2 m de profondeur, afin de mesurer les variations des variables environnementales susceptibles d'influencer la survie des smolts lors de leur migration vers le large.

Une présence plus longue des smolts de truites de mer dans les eaux estuariennes et côtières

Sur les 3 sites d’étude (Tamar, Frome et Bresle), les jeunes truites de mer ont été détectés plus longuement dans l’estuaire (plusieurs jours) que les jeunes saumons (environ 1 jour). De même, les premiers ont été détectés plus longuement dans les eaux côtières (quelques jours) que les seconds (quelques heures).

Des smolts de saumons plus rapides

La vitesse des jeunes salmonidés lors de leur migration est égale à 1,3 km/h en moyenne. Ils semblent ralentir leur migration à la transition entre eau douce et eau salée ou aux embranchements où plusieurs directions sont possibles. En détail, la vitesse de nage moyenne des smolts de saumons était supérieure à celle des smolts de truite de mer, leur permettant de traverser rapidement les zones dangereuses et d’éviter les prédateurs.

Une meilleure survie des smolts de truite de mer en estuaire

Tous sites confondus, la survie en estuaire a été estimée entre 51 à 91 % pour les smolts de saumon et de 73 à 97 % pour les smolts de truite. Elle apparait donc plus faible pour les smolts de saumons que pour ceux de truites de mer.

La distance parcourue par les smolts a diminué proportionnellement leurs chances de survie, mettant en évidence la difficulté des smolts à s’orienter dans certains estuaires (obstacles, attractivité, prédation…). La vitesse de migration, reflétant potentiellement la capacité des smolts à éviter les prédateurs ou à fuir les zones dangereuses, a eu un effet positif sur leur survie.

En revanche, les paramètres biologiques (longueur des smolts, condition physique, sexe et âge) et les paramètres environnementaux (température, salinité, oxygène dissous) ne semblent pas avoir joué sur leur survie.

s‍molt de saumon © LOGRAMI

Cette étude a démontré combien le passage des jeunes salmonidés migrateurs dans les eaux de transition peut être difficile. Les estuaires semblent constituer une étape cruciale dans la progression des smolts au cours de leur cycle de vie, pouvant entraîner des pertes importantes pour ces deux espèces.

‍Sources :

• ARTERO C., BEAUMONT WA., JOSSET Q., JEANNOT N., COLE A., REVEILLAC E., LAURIDSEN RB., 2021. Rapport n°1 sur le module de travail 1 du projet SAMARCH – Migration des smolts de truite de mer et de saumon atlantique dans les eaux de transition et les eaux côtières. Agrocampus-Ouest, OFB, Environment agency, INRAE : 46 pages.
• ARTERO C., GREGORY SD., BEAUMONT WA., JOSSET Q., JEANNOT N., COLE A., LAMIREAU L., REVEILLAC E., LAURIDSEN RB., 2023. Survival of Atlantic salmon and sea trout smolts in transitional waters. Mar Ecol Prog Ser 709 : pp91-108 - https://doi.org/10.3354/meps14278.

Rendez-vous le mois prochain pour un nouvel épisode !