Agir sans perdre le fil ! Article 7 : La gestion des poissons migrateurs en mer

Bretagne Grands Migrateurs lance en 2025 une nouvelle chronique "Agir sans perdre le fil !". Aujourd'hui, le septième épisode... 

La phase marine des poissons migrateurs amphihalins est essentielle au sein de leur cycle de vie : l’anguille, le mulet et le flet pour se reproduire et les aloses, le saumon et les lamproies pour grandir. Et ils y passent une grande partie de leur vie : 15 à 20 % chez l’anguille, de 30 à 50 % chez le saumon et les lamproies et 90 % chez les aloses (Baglinière et Acou, 2019 in Dubost et al., 2024) ! Malgré cela, la majorité des mesures de gestion se focalise sur l’eau douce...

Quelle gestion en mer ?

En mer, les poissons migrateurs doivent faire face à de nombreuses pressions dont les effets sur ces espèces sont encore mal connus. Les contaminants, les prises accessoires et la pêche seraient globalement les plus néfastes (Thiriet et al., 2018 in Dubost et al., 2024).   Bilan par espèce des types d’impacts directs affectant l’état écologique global des espèces du groupe « Espèces amphihalines » présentes dans la sous-région marine (SRM) Golfe de Gascogne (Thiriet et al., 2018 in Dubost et al., 2024)

Plusieurs réglementations bénéficient aux poissons migrateurs lors de leur séjour en mer :

• La directive Habitats, Faune, Flore (DHFF) 92/43/CEE vise la conservation des habitats naturels ainsi que de la faune et de la flore sauvages. Certains poissons migrateurs (lamproie marine, lamproie fluviatile, grande alose, alose feinte, saumon atlantique) font partie des espèces retenues pour la désignation de sites Natura 2000.
• La Directive-Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM), adoptée en 2008 (2008/56/CE), a pour objectif l’atteinte ou le maintien du bon état écologique des eaux marines européennes d’ici à long terme, notamment en préservant la biodiversité marine. A l’échelle de chaque sous-région marine, un Plan d’Action pour le Milieu Marin (PAMM) est élaboré tous les 6 ans et intégré dans les Document Stratégique de Façade (DSF). L’impact potentiellement fort des activités humaines dans les espaces marins et côtiers (pêche, énergies marines renouvelables, infrastructures portuaires, ouvrages à la mer…) a conduit à la formulation d’objectifs de réduction de ces pressions au sein des DSF, notamment en ce qui concerne les captures accidentelles et ciblées et la continuité terre-mer.

Des conventions communautaires et internationales dans la protection et la gestion des espèces et de leurs habitats participent également à la conservation des populations de migrateurs en mer : Convention de Berne, Convention de Bonn, Convention OSPAR pour la protection du milieu marin de l’Atlantique du nord-est , Convention de Washington sur le Commerce International des Espèces de faune et de flore Sauvages menacées d’extinction (CITES).

Statut de protection international et européen des poissons migrateurs amphihalins durant leur phase marine (Elliott et al., 2022 in Dubost et al., 2024)

Au niveau local, les efforts de conservation, visant à contrer la perte de biodiversité en mer, reposent sur les aires marines protégées (AMP) associées à la mise en place de mesures de gestion. Ce sont des espaces délimités en mer qui répondent à des objectifs à la fois de protection de la biodiversité marine et de gestion durable des activités maritimes. Il existe différents types d’AMP, toutes sous gouvernance multipartite (élus, experts, usagers, associations, Etat…), allant des zones entièrement protégées, à des zones autorisant des activités humaines durables, telles que des pratiques de pêche traditionnelles et artisanales.

Mieux connaitre pour mieux gérer

L’application de mesures de gestion et protection efficaces à l’égard des poissons migrateurs est freinée par le manque de connaissance propre à la phase marine de leur cycle de vie en raison de leur très faible densité en mer et du faible nombre de données qui en résulte. 

Le pôle OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (MIAME) a développé dans le cadre du programme MigrenMer une nouvelle approche de modélisation pour mieux connaître la répartition en mer des poissons migrateurs amphihalins à partir d’environ 170 000 données de pêches scientifiques et de suivi de pêche professionnelle depuis 60 ans.

En plus d’apporter un éclairage inédit sur la distribution des espèces amphihalines en mer, le projet a mis en évidence sur la zone de prédiction que (Eliott et al., 2024 in Dubost et al, 2024) :

• 55% des zones de forte présence des poissons migrateurs se situent dans des AMP
• Parmi ces zones au sein des AMP, seules 50 % préconisaient des mesures spécifiques pour protéger les poissons amphihali
• 62% des AMP désignées pour protéger ces espèces se situent en dehors des zones de forte présence, soulignant l’inadéquation et la protection insuffisante des AMP existantes pour ces espèces.

Probabilité de présence du modèle CMAP des poissons migrateurs amphihalins à l’intérieur (rouge foncé) et à l’extérieur (bleu foncé) des aires marines protégées (AMP). Les cellules en rouge foncé sont plus grandes que les cellules de base de la grille afin de garantir la visibilité des zones de présences prédites au sein d’AMPs. Une zone d’incertitude (jaune) est mise en avant lorsque les modèles ne convergent pas (BNiCAR < 0.4 et SOiCAR > 0.4). Les lignes en bleu turquoise représentent les AMPs désignées pour protéger les poissons amphihalins étudiées, les lignes noires représentent les AMPs n’étant pas spécifiquement désignées pour les protéger. (Eliott et al., 2024 in Dubost et al, 2024)

Dans le cadre de mise en œuvre des exigences de la directive Habitats, les modèles de distribution des espèces ont également été croisés avec les données de répartition des navires de pêches pour réaliser une analyse de risque pour identifier les secteurs à risque de capture accidentelle par la pêche maritime professionnelle (Toison et al., 2023 in Dubost et al., 2024). Ces secteurs feront l’objet d’études complémentaires pour confirmer les risques identifiés et prendre des mesures réglementaires si nécessaires. Dans le cadre de la DCSMM et de l’élaboration des PAMM, ces modèles se sont en revanche avérés insuffisants pour évaluer le Bon Etat Ecologique (BEE) des espèces vis-à-vis de leur abondance ou distribution spatiale à l’échelle des sous-régions marines.

La dynamique d'acquisition de nouvelles connaissances sur la phase marine du cycle de vie des poissons migrateurs amphihalins du programme MigrenMer doit se poursuivre pour répondre aux exigences des directives et besoins des gestionnaires. C’est l’un des objectifs du programme européen DiadSea 2023-2026 qui vise à améliorer la gestion durable et la conservation des poissons diadromes dans les habitats marins en développant notamment des méthodologies, analyses et applications pour évaluer globalement la phase marine et les menaces associées à l’échelle de la zone atlantique. En parallèle, le plan National Migrateurs Amphihalins (PNMA) devrait contribuer à valoriser ces connaissances et aussi à acquérir des données complémentaires pour caractériser les zones fonctionnelles en mer et en zone de transition. 

Source :

• Dubost G., Elliott S.A.M., Deleys N., Reveillac E., Rivot E., Acou A. & Beaulaton L. (2024). Rapport du projet « MigrenMer » : Synthèse et valorisation des connaissances disponibles sur les migrateurs amphihalins en mer. Rapport scientifique du pole MIAME. 81 p. + annexes.*

Rendez-vous le mois prochain pour un nouvel épisode !